הרב יעקב מדן, מראשי ישיבת הר עציון, טוען שמכתב הרבנים הצביע על בעיות אמיתיות שאנחנו חייבים להתמודד איתם, אבל חשוב להפריד בין בעיית ההתבוללות לבעיה החמורה יותר של כניסת גורמים עוינים לישראל, "מכתב הרבנים על איסור מכירה או השכרה של דירות לגויים עסק בשני נושאים שונים- בעיית נישואי התערובת מחמת השכנות עם הגויים ובעיית הגורמים העוינים שנכנסים לישראל. מן הבחינה ההלכתית לא ניתן לערב שני נושאים חשובים אלו, וכל אחד מהם דורש התייחסות שונה, ויש לו מקורות שונים בהלכה. בעיית נישואי התערובת לא אמורה להיות מטופלת באיסור גורף על גויים לגור בשכנותם של יהודים ושל יהודים בשכנותם של גויים, ומעולם לא טופלה כך". לדבריו עיקר הבעיה שאיתה צריכים להתמודד היא כניסת גורמים עוינים לערים בישראל, "לאחרונה מוזרם כסף ממדינות הנפט לצורך קניית דירות ובתים או שכירתם בשכונות יהודיות לטובת גורמים העוינים את המדינה היהודית. ברגע שגורמים אלו נכנסים לשכונה בכמות ניכרת הם עלולים להתנהג באלימות כלפי התושבים היהודים, והיהודים נותרים חסרי הגנה של ממש. גם המשטרה אינה אוהבת לטפל בתופעות אלו, ובמקרים רבים היא מתחמקת מהם בתואנות שווא. במקרים כאלו, מי שיכול עוזב את השכונה, ואם אינו מוצא יהודי למכור לו את דירתו, הוא ימכור אותה גם לגורם עוין. כך הבעיה תלך ותחמיר. הבעיות מוכרות לנו מן הפרעות בעכו, ביפו, וכן ממקרים ברמלה ובלוד, ולאחרונה בגבעת שפירא (המכונה בטעות 'הגבעה הצרפתית') ומשם הבעיה גולשת כבר גם לאוניברסיטה בהר הצופים, וישנם מקומות רבים שלא הזכרתי". הרב מדן קובע, כי במקרים בהם יש סכנה של כניסת גורמים עוינים, יש מצווה שלא להשכיר ולמכור דירות לערבים, "במקרים כאלו התירו חכמים לצורך גאולת בית יהודי ואדמה יהודית גם לחלל שבת מדרבנן (עיין גיטין ח' ובבא קמא פ'), ואל תהי קולא זו קלה בעינינו! ממילא ברורה דעתם של חכמינו על מי שמוכר את ביתו ואדמתו בדרך המחלישה את אחיזתנו בארץ לטובת אחיזתם של נוכרים.לאחרונה עלתה הבעיה בחומרה רבה בצפת. בצפת היו ערבים רבים ערב מלחמת השחרור, והעיר שוחררה בידי כוחות הפלמ"ח וההגנה בעבודה קשה וגם בניסים גדולים. הערבים לא שכחו זאת! לפני כשלושים ושש שנים רצחה חוליית מחבלים מלבנון עשרים ושלושה מילדי צפת שהתארחו בבית ספר במעלות בעת טיול. מתכנן הרצח ושולח החוליה היה פליט ערבי מצפת. לימים כתב אותו פליט עבודה בהיסטוריה לצורך קבלת תואר דוקטור. בחיבורו הכחיש את שואת יהודי אירופה. אגב, שמו הוא ד"ר מחמוד עבאס, וכינויו היום הוא אבו מאזן. אך זוהי פרשה אחרת. הערבים רוצים לשוב לצפת, והם עושים זאת בדרך שהזכרתי". הרב מדן משבח את רבה של צפת, הרב שמואל אליהו, על יוזמתו להילחם באותם גורמים עוינים, "היחיד שנחלץ במסירות נפש לעזרה ולהגנה על היהודים מפני המזימה הוא רב העיר, הרב שמואל אליהו. אך לדעתי, הרב אליהו טעה אגב עיסוקו במצווה טעה בניסוחו, ואף שעשה זאת בהתייעצות עם מומחים בכירים למשפט. וכך הדליק בניסוחו את כל שוחרי המלחמה בגזענות ונתן בידם קרני ברזל לנגח את מאבקו הצודק. לדעתי היה עליו לכתוב איסור למכור או להשכיר דירות לגורמים עוינים ולא להזכיר נוכרים ערבים או גויים, להזכיר רק 'גורמים עוינים". הרב מדן מצר על כך שגורמים משפטיים מעדיפים לחקור רבנים ולא לחקור את הערבים שנותנים עונש מוות למי שמשכיר בית ליהודים, "הפרקליטות, משרד היועץ המשפטי וגורמים אחרים במערכת המשפט וכל העיתונות התנפלו על הרב אליהו נר"ו ועל הרבנים שתמכו בו בטענות של הסתה לגזענות וכד', וזה מדאיג! אותם גורמים שותקים שנים כשהם יודעים שהווקף המוסלמי הוציא פסק דין מוות לכל ערבי המוכר את ביתו או את שדהו ליהודי. הווקף ותומכיו ביצעו לא מעט גזרי דין כאלו. בעיניי ראיתי ערבים מוכרי בתים שהוברחו לחו"ל בתחפושת ובשם בדוי. כל הווינשטיינים לא אמרו על כך מילה אחת ולא מחו על כך מחאה אחת! זו אינה מלחמה בגזענות! זוהי גזענות! הכול יודעים שיהודי אינו יכול לקנות בית בכפר ערבי. למיטב ידיעתי, עיתון 'הארץ' לא מחה על כך. זוהי צביעות והתחסדות, והיא מדאיגה עשרת מונים ממה שנראה לי כטעותו של הרב אליהו ושל הרבנים שתמכו בו". לדבריו, "הרב אליהו ותומכיו טעו בדבר מצווה, ומאבקם בנישול למעשה של יהודים משכונותיהם ומבתיהם הוא מאבק צודק, נכון וראוי לגיבוי ולתמיכה. אך עליהם לשנות את הנוסח של מכתבם ולהפיק לקחים להבא על מידת הזהירות הנחוצה בניסוחים ובהתנהגות שלא להביא חלילה לדברים המקשים עלינו לאהב את תורת ה' על עמו ישראל על כל סיעותיו".