בפגישה שנערכה בביתו של הרב עובדיה יוסף, בה נכחו הראשון לציון הרב עמאר וצמרת ש"ס. החליט הרב יוסף להעניק גיבוי הלכתי לגיורי צה"ל. במכתב שהפקיד בידי הרב הראשי הרב שלמה משה עמאר כתב הרב יוסף כי "גיורי צה"ל תקפים ע"פ תורתנו הקדושה", אך הוסיף כי יש לתקן ולשפר את המערך על פי המלצות הועדה שמינתה הרבנות הראשית. החלטה זו של הרב יוסף תסלול ככל הנראה את הדרך לחתימתו של הרב הראשי על אלפי תעודות ההמרה של חיילי צה"ל ובכך תושלם ההכרה החוקית בגיורים. נזכיר, כי הפרשיה התעוררה, לאחר שבדיון שנערך בבג"ץ התברר כי ראש העדה הדתית, כלומר הרב הראשי לישראל, לא חתם כחוק על תעודות ההמרה של המתגיירים בצה"ל ועל כן הגיורים לא אושרו כחוק. תחילה אמר הרב עמאר כי מדובר בבעיה טכנית בלבד אשר תיפתר תוך זמן קצר, אולם לאחר מכן החליט למנות ועדה שתבדוק את תוקפם של הגיורים קודם החתימה. ועדה ראשונה שמונתה על ידי מועצת הרבנות הראשית התפרקה, ואילו ועדה שניה שמונתה מבין מקורבי ש"ס גם היא לא הגיעה למסקנות שביקש הרב עמאר. לאור זאת התכנסו הבוקר חברי ש"ס בביתו של הרב יחד עם הרב עמאר על מנת להחליט כיצד לפתור את המשבר. גורמים בש"ס מעריכים כי הגיורים שנערכו בעבר יאושרו קולקטיבית, אולם במבט לעתיד תתאים עצמה מערכת הגיור הצבאית לסטנדרטים של המערכת האזרחית המקבילה.
