הכנסת הגישה לבג"ץ את תשובתה לעתירת פעילי השמאל נגד חוקתיות חוק החנינה למתנגדי ההתנתקות. כזכור דרשו העותרים מהשמאל כי בית המשפט יורה על ביטולו של החוק בטענה כי הוא פוגע בזכות החוקתית לשוויון, הנגזרת מחוק יסוד: כבוד האדם וחירותו, שכן אינו מעניק חנינה לכל מי שעבר עבירה "מצפונית" על רקע אידיאולוגי. . בתשובתה דוחה הכנסת את טענות העותרים וטוענת כי ההתנתקות היתה אירוע היסטורי ייחודי, חריג בעוצמתו ובהיקפו, במשמעותו הלאומית ובשבר שגרם ולכן מוצדק לאבחן אותו מאירועי מחאה פוליטיים אחרים. במישור העקרוני, טוענת הכנסת כי על בית המשפט העליון להגדיר את היקף הזכות החוקתית לשוויון, שלא נמנית במפורש על הזכויות שבחוק היסוד, באופן צר כך שרק הפליה על רקע "חשוד", כגון על רקע דת, גזע או מין, תיבחן במבחן חוקתי ולא כל הבחנה בין קבוצות שונות הנעשית בחוק, שכן הגדרה רחבה של הזכות החוקתית לשוויון תביא לאי יציבות ואי וודאות במשפט החוקתי וכן לזילות הזכות החוקתית. "לאירועי ההתנתקות היו משמעויות פוליטיות מרחיקות לכת. אך אין הדבר שולל את היותו ייחודי ורב משמעות לכל הציבור בישראל. אפיה ההיסטורי והטראומטי הביא לעיסוק אינטנסיבי בה של כל רשויות השלטון וכן בפורומים רבים אחרים", נכתב.
