שר הביטחון ברק חשף אחר הצהריים, כי ישראל חושדת שעל הספינה שנתפסה היתה התחלה של מערכת נשק מתקדמת שיועדה לעזה. "אני מברך את הרמטכ"ל החדש, בני גנץ – זו הפעולה המבצעית הראשונה של צה"ל שנחשפת לציבור תחת שרביטו, והיא מוצלחת. אני רוצה גם לברך אותו משום ששעות ארוכות לפני שאני, ואחריי ראש-הממשלה, אישרנו את הפעולה, נקט הרמטכ"ל בשרשרת של צעדים מקדימים שאפשרו לוודא שהפעולה הזאת, אם נחליט עליה, אכן תוכל להתקיים ותצליח", אמר ברק. לדבריו, "אנחנו חושדים, או חושבים, שבין אמצעי הלחימה יש גם התחלה של מערכת מתקדמת שיכולה להשפיע על חופש הפעולה שלנו לאורך החופים של עזה, אילו היא הייתה מגיעה לשם, ומכאן החשיבות של היירוט הזה. אני משאיר לרמטכ"ל לחשוף יותר מאוחר, עם הגעת הספינה בלילה לאשדוד, את תוכן המכולות". "אני רוצה לומר שחיל הים, שייטת 13, פעלו במהירות, בתכליתיות, ביעילות, ולשמחתנו ללא התנגדות, אבל גם על בסיס לקחים שנלמדו מהפעולות בשנים האחרונות. הפעולה כולה מוכיחה את החשיבות של הסגר הימי על עזה, ואת העובדה שעדיין קיים הציר הרדיקלי – אנחנו לא יודעים מה חלקם של הסורים, האיראנים, החיזבאללה, בשיגור הזה של אמצעי לחימה, אני מניח שנדע את זה בשעות או ביממות הקרובות כתוצאה מהתבהרות של דברים נוספים עם הנחת ידינו על אמצעי הלחימה. זו בסך הכול פעולה מוצלחת, אני מאחל לעצמנו שתמיד זה ייגמר בצורה הזאת, ושוב- ברכות למבצעים, לצה"ל ולרמטכ"ל", הוסיף ברק.
