מבקר המדינה מותח ביקורת חריפה על הדרג העליון של המשטרה, ובתוכו המפכ"ל דודי כהן והמפכ"ל המיועד יוחנן דנינו, בפרשיית רצח המקורות המשטרתיים.

המבקר בדק את תלונותיהם של שני ניצבי משנה בדימוס, ישראל אברבנל וד"ר סיימון פרי, לפיהן המפכ"ל דודי כהן והמפכ"ל המיועד ניצב יוחנן דנינו, ניסו לטייח את מחדלי המשטרה שהביאו להרצחם של שני מקורות משטרתיים ב-2006, בעת שכהן שימש מפקד מחוז המרכז ודנינו שימש ראש אגף החקירות והמודיעין.

המקרה הראשון נוגע לרציחתו של אייל סלהוב, עבריין מפרדס כץ, לאחר שאנשים מארגונו של אבי רוחן גילו שהפך לסוכן משטרתי. המקור השני, שזהותו אסורה בפרסום, נרצח כחודש אחר כך. מדובר בסוכן משטרתי שפעל בקרב משפחת הפשע ג'רושי, ומידע שמסר שכנע את הפרקליטות שלא להגיש כתב אישום נגד מי שהיו חשודים ברציחת הילדה לאה קטייב ודודתה נדיה בשנת 2005.

בהודעה מיוחדת שמפרסם בשעה זאת מבקר המדינה, נאמר כי "בירור התלונות מצא ליקויים מערכתיים משמעותיים בתפקודן של יחידות המשטרה   שחלקם נובע מאי-קיום נהלים. חמור מזה, חלק אחר נובע מתרבות ארגונית בלתי תקינה שקיימת למרבה הצער במשטרה ואשר מן הראוי לשרשה".

לדברי המבקר, "מטרידה במיוחד תופעה בולטת של חוסר אמון בין גורמי משטרה שונים, כולל בין בכירים שבהם. תופעה זו מעידה על הצורך הדחוף לתיקון התרבות הארגונית, החיונית כל כך לתפקודו של גוף מרכזי כמו משטרת ישראל. יש מקום גם לשיפור משמעותי בהטמעת ערכים של תרבות תחקיר והפקת לקחים".

המבקר הוסיף והדגיש, כי "צוות בירור התלונות נמנע מלקבוע אחריות קונקרטית לליקויים המערכתיים שנמצאו. עם זאת יודגש, כי האחריות הכוללת לדרך ההתנהלות רובצת מדרך הדברים לפתחו של הדרג הפיקודי העליון".

נזכיר, כי היועץ המשפטי לממשלה פרסם ערב ההחלטה על מינוי דנינו למפכ"ל חוות דעת, לפיה אין בתלונות הללו בכדי למנוע את המינוי, זאת למרות שבדיקת המבקר עדיין לא הסתיימה.

המבקר התייחס להחלטה זו בעקיפין, תוך שהוא מותח ביקורת על כך שנמנע ממנו לבדוק את הפרשה במשך זמן רב, "במהלך שנת 2008 התקבלו במשרד המבקר שתי התלונות המדוברות. לאחר שנציגי המשרד  נפגשו עם המתלוננים, שמעו את טענותיהם בהרחבה וקיבלו מהם מסמכים, הוחלט לבדוק את התלונות. בעקבות זאת ביקשו המשטרה והפרקליטות לדחות את בדיקת משרד המבקר עד שיסיימו את הבדיקות הפנימיות אצלם וכדי למנוע פגיעה בחקירת המשטרה. משרד המבקר נעתר לבקשה".

"לדעת משרד מבקר המדינה זה בלתי סביר שנדרשו למשטרה כמעט שנתיים תמימות לסיים את החקירות הפנימיות שקיימה בנושאים המדוברים. עקב זאת נמנע מהמבקר במשך הזמן הזה מלבדוק את הנושא, ולכן חידשנו את הבירור רק ב-17.8.10", נאמר בהודעה.