הורים בבית ספר ממלכתי דתי בפתח תקווה טוענים, כי משרד החינוך כופה עליהם להפריד את בית הספר בין בנות ובנים וזאת בניגוד לעמדתם, כך דווח בגלי צה"ל. לטענת נציגי ההורים, ועד הורי בית-הספר דן בנושא במשך שנה והחליט על לימודים משותפים, אך המשרד פסל את ההחלטה שהתקבלה והורה על הפרדת הכיתות. במכתב ששיגר הועד לשר החינוך, גדעון סער נאמר: "אתה כופה באופן בלתי סביר ובלתי מוצדק על ההורים לשלוח את ילדיהם לבית ספר מופרד מגדרית בניגוד לרצונם, בניגוד לדעתם ובניגוד להשקפת עולמם הדתית, החינוכית והערכית". במשרד החינוך טוענים מנגד, כי השיקולים אותם הפעיל המשרד הם שיקולים פדגוגיים, וכי גם עמדתם של ההורים איננה אחידה כפי שמנסה לצייר ועד ההורים.