הרב הראשי הספרדי, הרב שלמה עמאר, רמז בראיון לרדיו 'קול חי', כי יתכן ששריפת המסגד היא עלילת דם. "אנחנו למודי ניסיון. כידוע בכל הדורות היו עושים עלילות דם שהיו הורגים ילד נוצרי ותולים את זה ביהודים ועשו שמות בקהילות שלמות. הרג ואובדן רחמנא ליצלן מאותם עלילות שווא ומדוחי,ם ואי אפשר לדעת אם אין פה יד זדונית שמתכוונת לסכסך ולהרבות שנאה בין היהודים והערבים", אמר הרב בראיון. מוקדם יותר ביקרו הרבנים הראשיים יחד עם הנשיא פרס במסגד שהוצת, שם גינה הרב עמאר באופן תקיף את מעשה ההצתה. "אני וראשי הדתות זועקים את זעקתנו שייתפס האיש הנפשע וחזקה על המשטרה לנהוג בו במלוא חומרת הדין. זהו חילול השם, חילול מדינת ישראל וחילול כל העמים והדתות. כולנו חייבים לדבר בקול רם נגד הטרור", אמר הרב עמאר, וסיים בתפילת "עושה שלום במרומיו הוא יעשה שלום עלינו".
