שופטי בג"ץ, דורית ביניש, אסתר חיות וחנן מלצר, הורו על מחיקת עתירתם של המתמחים, אשר עתרו נגד החלטת בית הדין הארצי לעבודה אשר קבע כי התפטרותם איננה חוקית. השופטים ציינו בהחלטתם, כי "אנו מברכים על הסכמת הצדדים ועל תרומתם של השופט זמיר ופרופ' מירוני לגיבוש ההסכם. בנסיבות אלה, העתירה בבג"ץ 7569/11 תימחק". עתירה נוספת אשר הוגשה באותו הקשר, ואשר תקפה את ההסכם בטענה שהוא איננו תואם את הוראות "חוק שעות עבודה ומנוחה", תימחק גם היא, לאחר שהשופטים קבעו כי היא צריכה להידון בפני בית הדין לעבודה. "העותרים הודיעונו כי עומדים הם על עתירתם בכל הנוגע לסעדים שלא התייתרו על אף הסכמת הצדדים שהושגה במסגרת ההידברות. אין מקום לבירור טענות אלה בפנינו בשלב זה. הטענות עליהן עומדים העותרים במסגרת עתירתם טרם נדונו לגופן בבית הדין לעבודה ולפיכך העניין אינו יכול לשמש כנושא לעתירה, שכן הסמכות לדון בהן נתונה לבית הדין לעבודה", קבעו השופטים.
