ראש מכון המקדש, הרב ישראל אריאל, יוצא בחריפות נגד הדברים שצוטטו מפי הרב שלמה אבינר, לפיהם קרא למתפללי בית הכנסת שלו להישאר בבתיהם ביום שיבואו כוחות צה"ל להרוס את גבעת האולפנה. ביומן ערוץ 7 אמר הרב אריאל, "אני תמה במיוחד כשהדברים באים מרבנים שגרים בבית אל. שלא יבואו להפגנה, שלא יבואו למחאה, האם הרב קורא לאנשיו שלא ללכת לשם". לדבריו, זה מנוגד לתורת ישראל, "בעיניי זה מוזר, אני לא מצפה מרב שאמון על תורת ישראל שידבר בצורה כזאת. אנחנו לא צריכים להיות מודרכים על ידי שיקולים פוליטיים של מה יגידו העולם. ההיפך, שיראו שיהודי בארץ ישראל נלחם על הבית שלו. הרי כל העמים מתקוטטים על ארץ ישראל כבר אלפי שנים, יש כאן מלחמות הרוגים ופצועים. אז מה הבושה שיראו בעולם יהודים שנלחמים על הארץ הזאת". הרב אריאל מציין את דבריו של הרב צבי יהודה קוק, שאמר שאסור להתחשב בגויים, "בגווים לא יתחשב, כך הוא אמר. אנחנו, צריכים להתחשב רק במה שהקב"ה אומר. ודווקא כאן תמוה בעיניי שמבית אל יוצא קול כזה. הרי בשביל כל ילד יהודי, בית אל היא סמל. במקום הזה נאמר, הארץ שאתה שוכב עליה, לך אתננה ולזרעך. ארץ ישראל נקנית בייסורים, במקום הזה בבית אל, נאמר ופרצת ימה וקדמה צפונה ונגבה. לשמוע במקום הזה, קול ענות חלושה שאומרת לא ללכת למחאה ולהפסיד בכבוד, זה דבר מוזר מאין כמוהו". ראש מכון המקדש קורא להמונים לצאת ולמחות מול כוחות ההרס, "שפה יהרסו בתים ואנחנו נשב בבית, דבר כזה אסור להישמע. ליד הבית שלך הורסים בתים של יהודים ואתה תשב בבית? צריך להלחם על הארץ הזאת. אבל להגיד למתפללי בית הכנסת, שישבו בבתים שלהם זה דבר שאני לא מבין, זו לא תפיסה תורנית זו תפיסה של פוליטיקה". לדבריו, דווקא בערב יום השואה והגבורה אנחנו צריכים ללמוד את הלקח ממה שקרה אז, "הגבורה של היהודים בגטאות הייתה יותר גדולה מהחולשה שאנחנו מגלים פה, החל מראש הממשלה ומטה. יהודים נלחמו בגטו ורשה ולחמו מלחמת ייאוש". "לאן נעלמה היום הגאווה היהודית שלנו. אנשים חולים כאן במחלת הגלות, וקונים את התפיסה הנוכרית שלא מגיע לנו שום דבר בארץ ישראל. לכן ממשלה מחליטה להרוס בתים בארץ ישראל, אבל האם יעלה על הדעת שאנחנו נשב בשקט בבית. אפילו הבדואים בנגב שהורסים להם את הבית, הם נלחמים על הבתים שלהם ועוד להם אין תורה, אז אנחנו לא נלחם על בית שרוצים להרוס, בגלל איזה ערבי שטוען שזה שלו".