היועץ המשפטי לממשלה, יהודה ויינשטיין, אומר כי הר הבית הוא חלק משטחה של ישראל ולכן חל עליו הדין הישראלי ובכלל זה חוק העתיקות וחוק התכנון והבניה. עם זה, בשל אופיו היחודי של האתר יש ליישם את החוק ברגישות יתרה, ולתת את הדעת גם לשיקולים פרגמטיים. כך דווח בקול ישראל. בהנחיה ששלח בחודש שעבר ליועצים המשפטיים של רשות העתיקות, עיריית ירושלים והמשטרה, נכתב עוד כי על אף הרגישות, חייבות רשויות החוק לקיים פיקוח תדיר במתחם הר הבית, כדי לקבל תמונה כוללת של העבודות הנעשות במתחם ושל מידת השמירה על העתיקות. את הדיווחים תעביר רשות העתיקות למועצה לבטחון לאומי ולמזכיר הממשלה. וינשטיין מנחה עוד כי כאשר יש חשש להפרה מהותית של דיני התכנון והבניה ודיני העתיקות יש להתייעץ עימו. בעת האחרונה ביקרו בכיפת הסלע מפקד יחידת המקומות הקדושים וארכיאולוג מרחב ירושלים, בעקבות עתירה של תנועת נאמני הר הבית. הם מצאו כי בעבודות במקום לא נפגעה אבן השתיה, אך משטח הסלע מלוכלך וקבעו שיש לנקותו.
