בחודשים האחרונים מתנהלת חקירה ביחידה הארצית לחקירת פשעים בינלאומיים, בחשד להעלמות כספים בסכומים גבוהים באחד הארגונים במערכת הביטחון. החקירה מתמקדת בבעל תפקיד בארגון בחשד שהעלים סכום של יותר משני מיליון שקלים במשך חודשים. העובד החשוד במעילה הושעה מתפקידו. הפרשה אינה קשורה לדיווח לפני כחודש כי המשטרה מנהלת חקירה נגד ראש אגף במוסד בחשד ל"אי סדרים כספיים". הבכיר כזכור הושעה מתפקידו והמשטרה ממליצה להגיש נגדו כתב אישום. התיק בעניינו הועבר לפרקליטות - וממנו עולה כי נמצאה תשתית ראייתית שמבססת את החשד למעורבותו של ראש אגף במוסד באי סדרים כספיים. המשמעות היא שהמשטרה ממליצה להגיש כתב אישום נגדו.