המחלקה לחקירות שוטרים הגישה לבית המשפט השלום בירושלים כתב אישום נגד עמרי כהן ודני אברה, אשר שירתו בעבר כשוטרי חובה בפלוגת מג"ב אשר פועלת בגזרת העיר העתיקה בירושלים. בכתב האישום, מואשמים השניים בעבירות של תקיפה הגורמת חבלה של ממש, שיבוש מהלכי משפט ומסירת ידיעה כוזבת. על פי כתב האישום, השניים, אשר היו בפעילות מבצעית באזור שער האריות בעיר, פגשו בראפת עג'לוני והובילו אותו לבית הקברות הסמוך. שם היכה כהן בפניו של עג'לוני באמצעות קת נשקו של אברה שנמסר לידיו. כתוצאה מעוצמת המכה נפגע עג'לוני בפניו והחל לדמם. בכתב האישום נטען עוד, כי על מנת להסתיר את אופיו האמיתי של האירוע, עצרו השניים את עג'לוני והחליטו לדווח בכזב על המפגש עמו כעל אירוע של תקיפת שוטרים. השניים תיאמו ביניהם גרסה כוזבת בנוגע לנסיבות האירוע על מנת להכשיל חקירת מח"ש ועל מנת לשבש הליך שיפוטי עתידי. עג'לוני הובל על ידם למרחב דוד בעיר העתיקה ונחקר בחשד לתקיפת שוטר והעלבת עובד ציבור, כל זאת על בסיס דו"חות פעולה שקריים, אשר כתבו בנוגע להשתלשלות האירועים.