מרכז ברקאי עוסק בהכשרת רבני קהילות באופן מעשי תוך מתן דגש על קירוב לבבות ליהדות. המרכז מבקש לשפר את מרקם החיים בישראל, למנוע קיטוב, לחבק את הקהל המסורתי והחילוני ברשויות המוניציפאליות השונות, לצקת תוכן יהודי משמעותי לטקסים היהודיים ולחגי ישראל ולהעניק לכלל הציבור בישראל מנהיגות יהודית רוחנית מכילה ומחבקת בגובה העיניים. על פי הנתונים שבידי מנהלי המיזם, בישראל משמשים אלפי רבנים כרבני קהילות מבלי שעברו הכשרה מסודרת. "מענה לכך נותן 'מרכז ברקאי לרבנות מעשית'", הם מסבירים, "המרכז יכשיר רבנים לשמש כדמות קהילתית מאחדת ומחברת שתיתן מענה לצרכים החינוכיים ולדרכי החינוך הבלתי פורמאלי בקהילות ישראל". תוכנית ההכשרה אליה נבחרו 20 רבני קהילות מרחבי הארץ כוללת את מיטב המרצים שיעניקו לרבני הקהילות הכשרה רוחנית, פסיכולוגית ותקשורתית על מנת שאלו האחרונים יוכלו לבצע את עבודתם נאמנה. תוכנית המרכז זכתה לשבחים רבים ולתמיכה של הרב ישראל מאיר לאו שליט''א, לשעבר הרב הראשי לישראל וכיום רב העיר תל אביב יפו שישמש כנשיא התוכנית. גם יו''ר הסוכנות היהודית, נתן שרנסקי, הביע את תמיכתו בפרוייקט ואמר כי:''מעבר לחשיבות ההכשרה של רבנים בישראל להתמודדות עם מגוון הצרכים הגלומים בעבודה עם קהילה, יכול הפרוייקט לתרום תרומה משמעותית לאחדות עם ישראל ולכידותו''. באירוע הפתיחה של המרכז סיפר הרב לאו כי קרא למועצת הרבנות לדרוש סטאז' לתקופה של שנה מרבנים מכהנים בפועל: "רבנים צריכים הכשרה מעשית לא פחות מעורכי דין ורואי חשבון'' אמר הרב לאו וסיפר על הצורך בהכשרה של רבנים לעבודה מעשית בקהילות מניסיונו הרב כרב קהילה רב בית כנסת רב עיר ורב ראשי. הרב לאו הסביר על חשיבות ההכשרה המעשית של רבני קהילות ואמר: כי:''אפשר ללמוד שנים בכותל ולא לדעת מה זה אוצר מים של מקווה ולתת פתרון לדברים יומיום, אני זוכר איך בפולין היו מביאים חברי הקהילה מהרבנים דליים מלאים בחלקי עופות לרב על מנת שיבדוק את כשרותם''. הרב לאו קרא לרבני הקהילות לפעול בקרב שלושה מעגלים: המעגל הראשון, חילונים שלא מכירים ומכבדים את ההלכה בדרך מיוחדת צריך לעבוד עם היהודים ולהכניס אותם, במעגל השני בו יש יהודים של שבת ומועד, במעגל הפנימי יש יהודים שקיבלו על עצמם עול תורה ומצוות, ומרכז ברקאי צריך להכשיר רבנים לתת מענה על כולם'' הרב שלמה סובול אמר כי:''רבני הקהילות יהפכו את בית הכנסת ללב הקהילה וימשיכו את המסורת המפוארת של רבני קהילות יהודיים בעידן המודרני עם כלים חדשניים ועם ארגז כלים הלכתי ומעשי לשימוש הקהילות''.
