ישיבת הר עציון באלון שבות העלתה על הכתב בעיות הקיימות במסלול השירות הצבאי של תלמידי ישיבות ההסדר. במסמך שהגיע לידי ערוץ 7 וכותרתו "מסלול ההסדר – שיפור השירות הצבאי" מפרטים בהר עציון טענות המופנות לאגף כח האדם בצה"ל. כותבי המסמך טוענים כי אכ"א מוביל מהלך ארוך ועיקבי של פגיעה משמעותית ומתמשכת באיכות השירות של חיילי ההסדר, "החיילים מתקשים 'לכוון גבוה' בשירותם הצבאי, עובדה זו מורידה את המוטיבציה ואת טיב השירות", לטענתם צה"ל הוא זה שמשדר להסדרניקים שלא "לכוון גבוה" ולפי המסמך הדבר מביא "להקטנת ראש מתמשכת אצל חלק לא מבוטל מהחיילים". "כדי שהחברה הישראלית תמצא את הפוטנציאל הגבוה שנמצא בין בחורי ה'הסדר' חייב לבוא שינוי באיכות השירות הצבאי", מודגש כי השינוי באיכות השירות לא יהיה על חשבון מערכות צבאיות אחרות "אלא ייצור מצב של win-win". במשך שנים הייתה אפשרות להסדרניקים לשרת בסיירות מובחרות, "אם יצליח – יעזוב את ההסדר ואם ייפול – יחזור להסדר", מסלול זה בוטל ולכן מספר המתנדבים לסיירות בקרב ישיבות ההסדר, התמעט מאוד. בנוגע ליציאת הסדרניקים לקורס קצינים, אומרים בהר עציון כי צה"ל מחייב את החיילים לשרת מספר חודשים מעבר לשירות המקובל (16 חודשים) והם מנתקים על כרחם את החיילים ממסלול ההסדר. מתוך הבנה שקציני ההסדר מחזירים את ההשקעה בהם בעת שירותם במילואים, כותבי המסמך מבקשים כי "יוחזר מסלול הקצונה המותאם, ובנוסף תיבנה תוכנית כיצד למצות את היתרון היחסי של בחורי ההסדר כקצינים בעלי אינטילגנציה גבוהה יחסית כדוגמת תחום קציני המטה במפקדות חטיבה ואוגדה". שיפור המציאות חייב להתחיל אצל אנשי אגף כח האדם, טוענים בהר עציון, "הכיוון שלהם צריך להפסיק להיות איך לייבש את ההסדר אלא איך למצות את המירב מבחורי ההסדר", בנוסף נטען כי יש להחזיר את אפשרויות המיון למסלולי שירות ייחודיים כמו סיירות, קורס טייס וחובלים. בהר עציון סוברים שתלמידים הרוצים ללמוד שלוש שנים בישיבה ואז להתגייס לשירות מלא- יש לאפשר להם לעשות זאת, כיום הבחורים שרוצים ללמוד שלוש שנים לפני הגיוס חייבים להיכנס למסלול של 'תורתו אומנתו' ורק אז לוותר על המסלול, כותבי המסמך מציעים שהצבא יאפשר לבחור שהתחייב לעשות שלוש שנים להוסיף עוד תקופת לימוד בישיבה לפני השירות הצבאי המלא. במסמך מודגש כי הוא אינו בא לדאוג לאינטרסים של ישיבות ההסדר, ״כבר תקופה ארוכה שמסלול ההסדר זוכה לעלייה מתונה ומתמדת בכמות התלמידים", עם זאת צויין כי ישנן נקודות אותן יש למצות בצורה מיטבית "לשיפור תרומתם הצבאית בצורה איכותית". תגובת דובר צה"ל: "חיילי מסלול ההסדר מאופיינים ברמת מוטיבציה רבה לשירות משמעותי ועל אף איכותם הגבוהה, קיים קושי במיצוי יכולותיהם עקב פרק הזמן הקצר בו הם משרתים בצה"ל. בשיתוף איגוד ישיבות ההסדר, נבחנת באגף כוח האדם מדיניות אשר תאפשר הארכת שירותם של הקצינים".
