בעקבות התבטאויותיו המדיניות האחרונות של נשיא המדינה, שמעון פרס, שיגר אליהו ניסים, המגדיר עצמו 'פעיל למען ארץ ישראל' ליועץ המשפטי לממשלה ולמבקר המדינה מכתב בו הוא דורש לעצור את ההתבטאויות הללו, התבטאויות המנוגדות לחוקי המדינה. בראשית מכתבו מזכיר ניסים את חוק יסוד נשיא המדינה סעיף 11 הקובע את סמכויותיו של נשיא המדינה וקובע כי "בהתאם לחוק, לאורך שנות קיומה של המדינה היה מקובל שאין הנשיא מתבטא ופועל בנושאים מדיניים מובהקים". לעומת זאת נשיא המדינה הנוכחי, כותב ניסים "חושב שהוא מכהן כנשיא במשטר נשיאותי והוא אינו חדל לרגע, מעת שנכנס לתפקידו, להתבטא ולפעול בנושאים פוליטיים מדיניים באופן פומבי". "בתחילת השנה האזרחית, בשתי הזדמנויות שונות התבטא פרס בפומבי בצורה החורגת לחלוטין מסמכותו כשאמר בכנס שגרירי וראשי נציגויות ישראל בעולם שהתקיים ב-30.12.12 בבית הנשיא בהשתתפות כ-160 שגרירים "על ישראל לבצע שלום באופן מיידי וללא דיחוי" והוסיף "אני מכיר את אבו מאזן 30 שנה, הוא המנהיג הערבי היחידי שקם ואומר בפומבי כי הוא בעד שלום ונגד טרור. ואם לא די בכך הוא חלק שבחים לאבו מאזן על "מעשיו האמיצים למניעת טרור". באירוע אחר שהתקיים זמן קצר לאחר מכן, ב01.01.13 לרגל השנה האזרחית החדשה אמר פרס כי ישראל תהיה מוכנה לדבר עם החמאס רק אם יקבל את תנאי הרביעייה הבינלאומית, הקוורטט - הפסקת הטרור, הכרה במדינת ישראל והכרה בהסכמים שישראל חתמה עם הרשות הפלסטינית", כותב ניסים ומזכיר כי "דבריו אלה של פרס הביאו לביקורת חריפה מצד שרים, חברי כנסת לרבות יו"ר הכנסת דאז, ראובן ריבלין, שאמר כי על הנשיא אסור להתערב בנושאים מדיניים וכי יש באמירות אלה התרסה כלפי ממשלה נבחרת במדינת ישראל". בהמשך מכתבו מזכיר ניסים למבקר המדינה והיועץ המשפטי כי "ביום חמישי האחרון (23.05.13) הוציאה לשכת הנשיא הודעה לתקשורת בה נכתב כי 'נשיא המדינה שמעון פרס, קיים הערב (ה') פגישת עבודה מדינית עם מזכיר המדינה האמריקאי ג'ון קרי. במסגרת הפגישה שהתקיימה בארבע עיניים דנו השניים בדרכים ליציאה מהקיפאון המדיני ולמציאת פריצת דרך לתחילת משא ומתן מדיני בין ישראל והפלשתינאים'. היום פורסם כי שמעון פרס לוקח חלק בכינוס הכלכלי העולמי WEF בירדן. בכינוס, שכותרתו יציאה מן הקיפאון המדיני, ישתתפו בין השאר, יו"ר ארגון הטרור אש"ף, מחמוד עבאס, מלך ירדן עבדאללה ומזכיר המדינה האמריקאי, ג'ון קרי, וכן ראשי מדינות, שרים ואישים בכירים ממצרים, לוב, עיראק, ירדן, כווית, לבנון, קטאר, מרוקו, איחוד האמירויות, ערב הסעודית, בחריין, פקיסטן, טורקיה ועוד". עוד פורסם, מזכיר ניסים, כי נשיא המדינה עומד לשאת הערב (א') בכינוס נאום דרמטי בו הוא עתיד לפנות באופן ישיר ליו"ר ארגון הטרור אש"ף, מחמוד עבאס, ולומר מעל דוכן הנאומים: "אתה הפרטנר שלי ואני הפרטנר שלך. בוא נקדם את השלום. אני יודע שאתה יודע שאין בינינו הרבה פערים. אני יודע שאתה יודע שגם הפערים הקיימים ניתנים לגישור. ישראל רוצה שלום. יש אצלנו רוב מובהק לפתרון מדיני תחת הנוסחה של שתי מדינות לשני עמים בקווי 1967, עם תיקוני גבול מוסכמים ושוויוניים. אנחנו כמהים לשלום". כמו כן ציין והזכיר כי על פי הדיווחים מירדן, מיד עם כניסתו למליאת הוועידה, נתן הנשיא פרס הצהרה למאות אנשי התקשורת מכל העולם ואמר: "זהו הזמן לשלום. ישנה הזדמנות, לאחר מינויו של מזכיר המדינה ג'ון קרי, עשייתו עד כה ותמיכת הכלל בשלום - ולכן אסור לנו להיות ציניים". עוד אמר כי "ישנו סוף מוסכם לסכסוך והוא שתי מדינות לשני עמים, אשר חיות זו לצד זו בשלום ובצדק. אני מאמין ויודע כי ניתן להתגבר על הפערים בין הצדדים- תוך זמן קצר. זהו הרצון והצורך של כל הצדדים". בדבריו קורא ניסים למבקר וליועמ"ש כמייצגי החוק בישראל והממונים על אכיפתו "בשם אזרחים רבים ושואל: איך מתאפשר למר פרס להתבטא בצורה כזו למול מאות גופי תקשורת מכל העולם, למול מאות נציגים של מדינות זרות? שמעון פרס איננו ראש הממשלה ואף לא שר החוץ. הוא לא נבחר על ידי הציבור ואינו ראשי לדבר בשמו. מטבע הדברים - וודאי שאין לו שום מנדט לתת הצהרות כמו ההצהרות הנ"ל, הצהרות חסרות שחר שאין להן שום אחיזה במציאות. האם החוק בישראל הוא רק בגדר המלצה? האם להליך הבחירה של אזרחי ישראל ביום הבחירות אין כל משמעות? האם אין גבול למה שנעשה ונאמר בשם מדינת ישראל ובשם הציבור בישראל ע"י אדם אחד שכאמור לא קיבל מהאזרחים או מהחוק את המנדט להתבטא ולפעול בנושאים פוליטיים ומדיניים?". לדבריו "אין שום יכולת או זכות לאף אדם בעולם להצהיר בשמנו כי אנו מוכנים לגדוע ממנה חלקים ולמסרם לאויב. זהו שקר גמור, חסר כל בסיס או קשר למציאות ואין שום סיבה שיתאפשר לו להיאמר, למול מיליוני אנשים בכל העולם, ע"י אדם שמעולם לא נבחר על ידנו ואף אין הוא מוסמך בחוק כלל להתבטא בנושאים אלו". "אני פונה אליכם בכל לשון - אנא עשו סוף לשערורייה המתמשכת הזאת. פנו בהקדם המיידי למר פרס והודיעו לו כי מעשיו המתוארים לעיל אינם חוקיים. דרשו ממנו לחדול מייד מלהמשיך בהם או להתפטר מייד מתפקידו", חותם ניסים את מכתבו.
