הרב עובדיה יוסף הסביר בדרשתו השבועית במוצאי שבת את דבריו הקשים של ראש ישיבת 'פורת יוסף', הרב שלום כהן, שכינה את חובשי הכיפות הסרוגות - "עמלקים". הרב יוסף טען כי כוונת הרב כהן היתה רק לעסקנים פוליטיים "שגזרו גזירות נגד עולם התורה". "ראש הישיבה שלנו רבי שלום כהן דיבר כמה דברים נגד הכיפות הסרוגות, אבל לי אין שום ספק שהוא לא מתכוון על אותם שהם לובשים כיפות סרוגות. "וכי הכיפה הזו היא מעידה מיהו האדם? כוונתו רק איזה פוליטיקאים שעזבו מקור חיים ועשו שיתוף פעולה עם אנשים שגזרו גזירות על עולם התורה. שאר כיפות סרוגות כולם אהובים. מעולם לא ידעתי מה זה כיפה סרוגה מה זה כיפה שחורה, זה לא כלום". בשבוע שעבר השווה חבר מועצת החכמים של תנועת ש"ס, הרב כהן, את אנשי הכיפות הסרוגות לעמלקים, כהגדרתו, "כתוב מלחמה לה' בעמלק. אין הכסא שלם כל עוד שיש עמלק. כ''ס זה כיפה סרוגה. כל עוד שיש כיפה סרוגה, אין הכסא שלם! זה עמלק... מתי יהיה הכסא שלם? כשאין כיפה סרוגה... אלה יהודים אלה?".
