ארדואן הפר את הברית ההיסטורית עם ישראל. טורקיה חשפה בפני איראן רשת מרגלים ישראלית מקומית שפעלה באיראן - כך גילה הבוקר (ה') בעל הטור האמריקני דיוויד איגנשיוס בעיתון "וושינגטון פוסט". על פי הדיווח, המהלך בוצע בתחילת השנה שעברה על ידי ראש הממשלה הטורקי, רג'יפ טאיפ ארדואן, לא ברור אם בעקבות התדרדרות היחסים בין אנקרה לירושלים באופן כללי או בגלל המשט הטורקי. העיתון האמריקני מדווח עוד כי ראש הממשלה, בנימין נתניהו, רתח על הפעולה של עמיתו הטורקי, עד כדי כך שהפרשה מסבירה מדוע הוא סרב במשך זמן כה רב להתנצל בפני טורקיה על אירועי המשט לעזה. במוסד, כך נאמר בדיווח, הופתעו מאד מהתנהגות הטורקים ולא האמינו כי אחרי 50 שנים של שיתוף פעולה יסגיר ארדואן את הרשת לידי האוייב המר של ישראל. מדובר בברית חשובה שנרקמה בין שתי המדינות כבר מימי בן גוריון ולכן מדובר במידה מסויימת בחציית קו אדום מבחינת ישראל. בחודש מרס התנצל נתניהו בשיחת טלפון בפני ארדואן, בנוכחות הנשיא אובמה, במהלך ביקורו של הנשיא האמריקני בישראל. פקידים ישראליים בכירים אמרו כי למרות ההתנצלות נמשך המתח החריף עם ארדואן.
