לכתבנו חגי הוברמן נודע כי ההתפטרות נבעה מחילוקי דעות לגבי מידת שיתוף הפעולה בין מועצת יש"ע לבין מטה גוש-קטיף. בין שני האירגונים שרר בשבועות האחרונים חוסר אמון חריף. ליברמן ניסה ככל יכולתו להגביר את שיתוף הפעולה בין שני האירגונים, ואף קיים מספר ישיבות עם מטה גוש-קטיף, אולם חש כי לא קיבל מספיק גיבוי מחבריו למועצת יש"ע. ליברמן היה בעבר חבר מועצת יש"ע, כראש מועצת קרני-שומרון לשעבר. כתבנו חגי הוברמן מוסיף כי כעת נעשים מאמצים מחודשים להביא לשיתוף פעולה בין מועצת יש"ע לבין מטה גוש-קטיף, למען הצלחת המאבק.