לקראת חג הפסח, מדי שנה, מקיימת ישיבת מרכז הרב אפיית מצות מצווה לקראת חג הפסח. ראש העיר ירושלים, משה ליאון, הגיע לישיבה והשתתף בהכנת המצות יחד עם הרב שפירא.
ראש העיר עבר בין התלמידים, בחן את תהליך אפיית המצות, ושמע מהרב יעקב שפירא על שלבי ההכנה והחשיבות שבהקפדה על הפרטים הקטנים.
"מרגש מאוד לעמוד כאן יחד עם הרב ולאפות את המצות המיוחדות – המצות השמורות לפסח. בכל שנה אני מגיע לכאן, ובכל פעם אני מתרגש מחדש. אני חושב שאין הכנה טובה יותר לחג מאפיית מצות, יש לנו אפיית מצות בכל המנהלים הקהילתיים בירושלים ואני מזמין את כולם להגיע ולהשתתף", אמר ליאון.
הרב שפירא הוסיף "אין שום אכילה במהלך השנה כולה שהיא מדאורייתא, פרט לאכילת המצה בליל הסדר, ולכן יש לה חשיבות מיוחדת".